La présence d’Antoine Waechter, n°2 sur la liste EELV dans la circonscription Est (Alsace, Bourgogne, Champagne-Ardennes, Franche-Comté, Lorraine), fait polémique. Gabriel Amard, secrétaire national du Parti de gauche et tête de liste du Front de gauche, reproche au président du Mouvement des écologistes indépendants (MEI) un entretien accordée à l’hebdomadaire Minute en octobre 2013.
Dans cet entretien, Antoine Waechter attaquait Europe écologie-Les Verts et Dominique Voynet, Noël Mamère et Daniel Cohn-Bendit :
« Chez les Verts, il y a une culture d’extrême gauche qui refuse tout leader qui serait capable d’imposer une unité, de fixer une ligne de conduite. » « Chez les Verts, c’est une règle : celui qui réussit ou peut réussir doit être dégommé ! » « Avec les écologistes d’extrême gauche, c’est effectivement toujours plus compliqué, (…) dans les régions où ils sont majoritaires, le dialogue devient rapidement plus tendu, plus électrique, voire impossible. »