Pascal Balmand, Secrétaire général de l’Enseignement catholique, a publié un communiqué à propos de la méprisable polémique du ministère à propos du manuel de la Fondation Lejeune distribué dans les établissements catholiques :
"[…] Parce qu’ils entendent contribuer à la formation globale des jeunes qu’ils accueillent, les établissements catholiques ne sauraient occulter les diverses questions humaines susceptibles de se poser à chacun au cours de son existence. Ils veulent y travailler dans le respect de la liberté de toutes les consciences, à travers une éducation au discernement qui n’interdit pas, bien au contraire, la proposition de repères anthropologiques clairement formulés.
Il est donc parfaitement légitime que la parole portée par les responsables de ces établissements soit habitée par une vision chrétienne de la personne et de la société : le contraire s’avérerait pour le moins incohérent. Le respect de la vie en général et de toute personne en particulier constitue l’un des piliers de cette vision chrétienne […].
A l’échelle nationale, le Secrétariat général de l’Enseignement catholique poursuit son activité de formation et d’information entamée depuis plusieurs années, notamment au sein du groupe de travail Education Affective, relationnelle et sexuelle qui a édité en avril 2010 un document intitulé : « l’éducation affective, relationnelle et sexuelle dans les établissements catholiques d’enseignement ».
Aux différentes échelles locales, de nombreux diocèses ont construit ou construisent des ressources pédagogiques de grande qualité. Dans chaque établissement, c’est au Chef d’établissement que revient la responsabilité des modes de sensibilisation mis en oeuvre, en lien avec les membres de la communauté éducative, professionnels de l’éducation et de l’enseignement, acteurs de l’animation pastorale et représentants des parents. Ils réfléchissent ensemble au choix des outils, des intervenants, des parcours qui permettront aux élèves de former leur esprit critique, d’exercer leur discernement et de se déterminer en conscience et en liberté sur ces questions.
Que l’on interroge la tonalité d’ensemble ou certains passages précis de tel ou tel document – parmi bien d’autres – utilisé dans tel ou tel établissement – parmi bien d’autres – est une chose, qui relève à la fois de l’appréciation de chacun et d’une analyse éducative et pédagogique raisonnée. Que l’on s’étonne qu’une parole chrétienne soit proposée à tous au sein des établissements catholiques en est une autre, et cet étonnement même a de quoi surprendre. Tout en rappelant qu’il n’est nullement contraire à la loi Debré de susciter la réflexion et de témoigner d’une réflexion chrétienne dans le cadre de ce que les textes en vigueur appellent la « vie scolaire », le Secrétariat général de l’Enseignement catholique invite donc chacun au calme et à la raison : l’éducation des jeunes d’une part, les questions de bio-éthique d’autre part, correspondent à des enjeux trop importants pour que nous ne cherchions pas d’abord et avant tout à les aborder dans le cadre d’un dialogue respectueux et pacifié."